全外显子测序
技术介绍
全外显子组测序（Whole Exome Sequencing，WES），利用序列捕获技术将全基因组范围内的外显子组区域DNA区域进行捕获富集，之后进行高通量测序。 外显子是蛋白编码区域，仅占基因组的1%，而人85%的致病突变位于外显子区域，所以对外显子进行高通量测序可以有效挖掘变异与疾病的关系。 具有低成本、高测序深度、精确且有效监测遗传变异等优势，尤其适用于大量样本的测序分析。
技术路线
送样要求
| 样本类型 | 样本处理类型 | 样本需求量 | 样本浓度 | 样本纯度 | 样本质量 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 无降解且无蛋白和 RNA 污染的双链 DNA 样品 | 常规样本 | 大于等于400ng | 大于等于10ng/µl | OD260/280=1.8~2.2 | 7 ≤ RQN | 临床的血液、肿瘤组织样本的捕获特异性相对于其他类型的样本偏低 |
| FFPE DNA | 石蜡包埋样本 | 大于等于1ug | 大于等于7ng/µl | OD260/280=1.8~2.2 | 经电泳琼脂糖检测无明显弥散条带 |
常见问题
Q1 ：外显子的测序数据量要求多少？
对于常规样本，一般10G/样本可以满足后续分析需要，对于异质性大、高频突变的组织，如肿瘤组织等，建议15-20G/样本。