科技服务
普通转录组测序主要是对真核生物mRNA进行文库的构建和测序。用于研究特定组织样本或者细胞在不同处理、不同阶段等特定条件下的转录状态。 测序数据可以进行基因的表达情 况,差异基因,功能富集,新转录本预测等生物信息学分析,为基础科研和临床研究助力。
样本需求量 | 样本浓度 | 样本纯度 | 样本完整性 |
---|---|---|---|
大于等于1μg | 大于等于100ng/ul | OD260/280=1.8~2.2 | 6.0 ≤ RQN |
样本需求量 | 样本浓度 | 样本纯度 | 样本完整性 |
---|---|---|---|
大于等于1.5μg | 大于等于100ng/ul | OD260/280=1.8~2.2 | 6.0 ≤ RQN |
样本需求量 | 样本类型 | 样本采集与保存 |
---|---|---|
50mg ≤ 动物组织,80mg ≤ 植物组织 | 未提取 RNA 的组织 | 样本收集后清除表面杂质后液氮速冻, -80℃保存 |
样本需求量 | 样本类型 | 样本采集与保存 |
---|---|---|
10^6 ≤ 细胞数量 | 培养细胞 | 细胞沉淀加 trizol 混匀后-80℃保存 |
样本需求量 | 样本类型 | 样本采集与保存 |
---|---|---|
3ml ≤ 血液体积 | 临床病人或实验动物全血 | 采血管请务必使用EDTA/柠檬酸钠抗凝剂的采血管中(紫盖),避免 使用其他类型采血管。血液采集后立即轻柔颠倒混匀, 防止凝血。 |
哺乳动物血液中的 RNA含量低且极其容易降解,如果客户具备提取条件,建议客户取新鲜血液直接提取,可大大提高提取的成功率,如果不具备提取条件,建议采取以下三种方式寄送,不能直接液氮速冻送样(冰冻血液的溶解过程中会有破碎的细胞释放 RNA 酶,引起 RNA 降解,因此建议样品在冻存前分装好样本,避免冰冻样本再次溶解分装造成的 RNA 降解):
样本需求量 | 样本采集与保存 |
---|---|
5*10^6 ≤细胞数量 | 菌体样品除去培养基收集菌体后,立即液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送 |
用于提取 RNA 的医口组织送样,建议优先选择液体送样(即将样本放在 RNAlater 等 RNA 保护液或者Trizol 中送样),以防 RNA 降解。
人类精子中含有微量RNA,提取难度高于普通细胞类型。
样本需求量 | 样本采集与保存 |
---|---|
10^7 ≤细胞数量 | 细胞沉淀加trizol 混匀震荡后-80℃保存 |
注意:若需要对精子进行纯化,即去除精液中的非精子细胞,则使用Percoll等梯度液除非目的细胞。
对于样品存在上述风险,合作伙伴仍要求建库,由合作伙伴承担责任与风险。
Q1:普通转录组测序数据量一般要求多少?
对于有参考基因组的物种,一般推荐6G,而如果要检测更多低丰度的转录本,则推荐10-12G。
Q2:转录组测序需要几个生物学重复?
转录组测序需要几个生物学重复?
至少做2个生物学重复,有条件的建议做3个及以上。