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简化甲基化(RRBS )测序

技术介绍

RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) ,即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术,是利用限制性内切酶对基因组进行酶切, 富集启动子及CpG岛等重要的表观调控区域,并与亚硫酸氢盐测序相结合,对高CpG区域进行甲基化测序。 相比较WGBS ,RRBS仅需要对约占基因组1%的高CpG区域进行测序 ,因此具有测序成本低,精准,测序深度高等优点,在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用前景。

技术路线


送样要求

样本类型 样本量 收样步骤 运输方式
DNA 基因组≤1.5G:3µg
1.5G≤基因组≤3.5G:6µg
基因组条带经琼脂糖电泳检测无弥散条带。
-80保存 干冰
组织 ≥2g(动物),≥5g(植物) 去除表面血渍或浮尘后液氮速冻,-80保存。 干冰
全血样本 血液体积≥2ml EDTA/柠檬酸钠抗凝剂采血管(紫盖)采集,立即轻柔颠倒混匀, 防止凝血,液氮速冻,-80保存。 干冰

常见问题

Q1:RRBS推荐测序数据量?
对于常规样本,一般10G/样本可以满足后续分析需要,对于异质性大、高频突变的组织,如肿瘤组织等,建议15-20G/样本。